Каждой мухе предварительно стреляют в затылок из маленького пистолетика. Массу пуль вычитают.

Более серьезно - в герметической банке масса мух не зависит от их летания.

Совсем серьезно - их просто предварительно усыпляют досмерти хлороформом.